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可以说变形金刚里的矩阵本质上和黑客帝国中的矩阵是同一个东西，只不过是它的进化升级版。
明确了变形金刚中矩阵的含义，再确定火种的含义就很容易了。一个变形金刚的火种就是在矩阵空间中承载着一个独立个体意识的能量与信息的集合。
由此我们还可以简化矩阵的定义，矩阵就是容纳并连接所有火种，并为火种的活动提供规则环境的空间。
火种这一名词概念，真正被明确提出，其实是相当晚了，是在《变形金刚…超能勇士》（transformers…beastwars）的第15集《火种》（thespark）中才有的。由这一集中，我们得到的火种概念是，当火种燃烧的时候，对应变形金刚就活着，甚至躯体被毁灭都可以修复；如果火种熄灭，对应的变形金刚就死了，即便躯体完好也无济于事。结合其他剧情，我们也可以知道，变形金刚的智能，核心记忆，性格个性，以及行动的主要能量也都来源于自身的火种，并且因为火种的关系还有性别之分。正因为如此，变形金刚和我们传统意义上所知道依靠装置在体内的电脑硬件，电池，电路来行动的机器人完全是不同的概念（一些人按照理解传统机器人的方式对变形金刚提出的疑问，其实是他们对变形金刚基本了解都没有）。
在g1美版95集变形金刚里，虽然没有明确提出火种的概念，但这一概念实际上已经初露端倪了。比如我们上面提到过的在《西格马向量》（即《魔力神球》）两集中，飞虎队与飞行太保被西格马向量赋予生命，其实已经牵涉到了火种的概念，只是没有明确提出这个名词而已。再比如更明显的是在g1动画的第62集《红蜘蛛叛变》中，红蜘蛛利用地球上的坦克飞机制造自己的部下，他到塞伯特恩的监狱里偷了一些闪闪发亮的纯能量状物体，然后把这些东西放到那些坦克飞机里，结果就产生了混天豹机器人部队，并且这些机器人的个性意识就是塞伯特恩监狱里关押了几百万年的囚犯。实际上红蜘蛛这里所偷的东西也就是《超能勇士》中明确称之为火种的东西。以后如红蜘蛛的鬼魂等剧集，牵涉到其实也都是火种概念。
那为什么我认为动画片里大部分地方称之为火种的东西，其实并不是火种，而仅仅是火种接口呢？
关键是我们在剧情里多次看到这样两种并存的说法，一方面说一个变形金刚死了，就意味着它的火种熄灭了；另一方面则说一个变形金刚死了，就意味着他的火种回到了矩阵。但这两中说法之间显然存在难以调和的矛盾。既然火种已经熄灭了，那它又如何能回到矩阵？而且不同的变形金刚可能在位于相距几光年，甚至几百几千光年的星球上，而矩阵又在什么地方？相距这么遥远的不同星球上的变形金刚死掉的时候，如果它们体内的那个是真正火种本体，又如何都能回到矩阵？此外，已经熄灭的火种就算回到了矩阵又有什么意义可言。
如果理解了我们在动画片里看到的那个在变形金刚体内的所谓火种其实不过是个火种接口，而非真正的火种，疑问就能烟消云散。可以判断，变形金刚，无论是活着的变形金刚还是名义上死掉的变形金刚，它们真正的火种都一直存在包含于矩阵之内，所不同的只是活着的变形金刚，他们在矩阵内的火种有一个和现实空间连接的通道接口，这就是我们在动画片里看到的那个位于变形金刚体内的光球状的火种接口。而当矩阵系统判断一个火种存在外部的接口，那么这个真正的火种本身虽然还位于矩阵内，但它和矩阵其他部分的联系就会被切断。而一个变形金刚死掉的时候，他在矩阵内的火种和现实空间连接的通道接口被关闭毁坏，也就是火种接口熄灭，而与此同时，它与矩阵其他部分的联系被恢复。
这样我们也就理解了为什么一个变形金刚死了，既说它的火种熄灭了，与此同时又说他的火种回到了矩阵。其实这里前一个火种是指火种接口，而后一个火种才是指真正的火种本身。而所谓的回到矩阵，也并非是从矩阵外回到矩阵内，而仅仅是恢复这个本来就在矩阵内的火种与矩阵其他部分的联系而已。而在动画片里的变形金刚们之所以把火种接口称做火种，这是因为他们本身对矩阵和火种的了解就相当少（在猛兽侠剧情中，他们甚至对oracle和西格马向量的存在一开始都不知道，把它们当成一个传说来对待），再加上他们看到的火种接口功能确实和火种差不多，所以就很自然的把这两者混淆起来了。
理解了火种接口和火种本身之间的区别，对以前变形金刚动画里一些曾经令人疑惑的剧情，也就豁然开朗了。比如擎天柱的两次复活。如果按照原先的理解，火种熄灭也就熄灭了，一而再再二三的复活显得很牵强。但现在就很好解释。在矩阵内代表擎天柱的火种始终是存在的，大电影里擎天柱死去只是他的火种接口熄灭了。
擎天柱第一次复活应该是第73集《五面怪的诡计》里，五面怪控制了其在汽车人坟墓里金属躯体，而当补天士把矩阵接口硬塞到他躯体内的，擎天柱真正火种通过矩阵接口又重新控制了机器身躯的电路，所以他才能摆脱五面怪的控制。而擎天柱的第二次复活则是五面怪通过修理，暂时强行恢复了他的火种接口，使得他在矩阵内的火种重新接入到现实空间中来，而夺回矩阵接口之后，矩阵又强化了火种接口，延长了火种接口延续的时间，这又使得擎天柱的第二次复活多活了一长段的时间。
更有典型意义，更能说明问题的是超能勇士中恐龙勇士的复活。在超能勇士的第35集英雄本色中，恐龙勇士以一敌六，壮烈牺牲，他的火种（其实是火种接口）熄灭了，他的身体最后也被彻底火化销毁了。若按照原先的认识，这是最典型的形神俱灭，半点复活的可能性都不存在，不象擎天柱的复活还可以说成是保留下来的旧躯体做凭借。但在超能勇士的最后，恐龙勇士却又凭借金属变体恐龙躯体重新复活，如何解释呢？金属变体恐龙是霸王龙用全新的原生体和从狂飙勇士（那个变形为金属大螃蟹拥有特殊火种接口的原生体x）火种接口上切割下来的一小部分，还有外星人那里获得的金属变体驱动器创造出来，它的躯体是全新制造的，它的火种接口也是来源于狂飙的一部分。按道理他和原先死掉的恐龙勇士没有任何关系，无论身体还是火种接口，充其量只是外型相似。但最后当狂飙和急先锋同归于尽的时候，原先的恐龙勇士的意识却进入了金属变体恐龙的躯体之内，如果明白我们看到的火种只是火种接口，就很容易理解了。
当狂飙勇士的火种接口主体被毁灭的时候，他在矩阵内真正的火种和矩阵其他部分的联系被恢复，而这时候位于金属变体恐龙体内的这小部分火种接口还和狂飙勇士的火种相连，这也意味着以狂飙勇士的火种为中转，金属变体恐龙体内的火种实际上成为了一个矩阵接口，而这实际上已经违反了矩阵规则。矩阵系统在这种情况下自动把与这个金属躯体匹配的恐龙勇士的火种与这个接口相连，同时断开恐龙勇士火种与矩阵其他部分的联系，就这样恐龙勇士复活了。但因为恐龙勇士的火种已经习惯了矩阵内的生活，因此在他复活后，又马上用自我牺牲来换取霸王龙行动的失败，毁灭了自己新的火种接口，重新和矩阵其他部分恢复了连接。
ps，摘自多年前看过的“杜车别”的网络文章，主要用来说明猪脚未来对于天网发展的设定，这对猪脚的未来发展极为的重要，看过的可以略过哈！。
第一卷热血龙珠世界第四十三章矩阵接口的辨析
更新时间：2011…11…20
对火种接口就解说就到这里告一段落，同理，我们在g1美版95集变形金刚里看到的那被称为矩阵（中文配音称之为能源宝或领导模块）的，可以被拿在手里，或者放置在变形金刚胸口的装置也并不是真正的矩阵，而仅仅是连接矩阵空间与现实空间的一个信息通道，信息接口。通过它，矩阵内部的信息与能量可以传输到矩阵外部的本空间来。
得出这样的论断也是有理由的。我之所以认为那个装置并非矩阵本身，而仅仅是矩阵接口，首先是因为从动画片可以看到那个装置的体积相当小，而按照现有的物理法则，一定空间内所能容纳的信息与能量是有限度的，是不可能超过某个上限的（比如刘慈欣的科幻小说《诗云》中那个和神类似的外星人，为了储存所有汉字组合的古诗，动用了整个太阳系的物质）。而矩阵从机器文明独立之初就已经存在，经过几百万年甚至几千万年的积累，其中包含的信息与能量的数量级是超出想象的（某种程度上可以一个宇宙相提并论），从基本的物理法则来说，它就不可能仅仅包含在一个那么小的装置内，认为在g1变形金刚中被称为矩阵的装置实际上仅仅是一个矩阵接口，而非矩阵本身更为合理一些。
其次在猛兽侠剧情我们可以更清楚的看到，那里已经不存在g1中被称为矩阵的那个小型装置，在任何地方我们都没有看到它的踪影。可见这个装置在变形金刚猛兽侠的时代已经不存在了，但是矩阵却依然存在。在猛兽侠第一集中，oracle就通过自己的力量把黑猩猩（optimusprimal）接入到矩阵中，这也可见真正的矩阵和g1中被称为矩阵的那个装置是两码事。g1的那个装置其实质仅仅是一个矩阵接口，矩阵内的一些特定能量与信息可以通过这个接口释放出来，而博派的领袖也可以通过这个接口在特定条件下进入矩阵，和矩阵内一些特定火种沟通。如此而已。到了猛兽侠时代，这个矩阵接口的装置已经失落不存在了，所以才由oracle自己直接把黑猩猩接入矩阵。
明白了火种接口和矩阵接口的含义，再回过头来看